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高效液相色譜儀和氣相色譜儀是兩種經典型也是最常用的色譜儀器，本文就這兩種色譜儀器來做一下比較，了解各自的性能、特點和區別。
一、流動相方面：
1、高效液相色譜儀
（1）液體流動相可為離子型、極性、弱極性、非極性溶液。
（2）液體流動相不僅起運載樣品的作用，同時對樣品組份有一定的親和力（排阻色譜除外）它會與固定相展開對組份的劇烈競爭，可與被分析樣品產生相互作用，并能改善分離的選擇性。因而對分離起很大的作用。
（3）液體流動相動力粘度為10-3Pa·s，輸送流動相壓力高達2～20MPa。
2、氣相色譜儀
（1）氣體流動相為惰性氣體，不與被分析的樣品發生相互作用，它僅起運載樣品的作用，
一般對分離結果好壞沒有影響。
（2）氣體流動相動力粘度為10-5Pa·s，輸送流動相壓力僅為0.1～0.5MPa
二、固定相方面：
1、高效液相色譜儀
（1）分離機理：可依據吸附、分配、篩析、離子交換、親和等多種原理進行樣品的分離，
可供選用的固定相種類繁多。
（2）色譜柱：固定相粒度小為5～10um；填充柱內徑3～6mm；柱效為103 ～ 104 ，柱溫為常溫。
2、氣相色譜儀
（1）分離機理：依據吸附、分配兩種原理進行樣品分離，可供選用的固定相種類較多。
（2）色譜柱：固定相粒度大0.1～0.5mm；柱內徑為1～4mm，柱長1～4m，柱效為102 ～ 103毛細管柱內徑為0.1～0.3mm，柱長10～100m，柱效為103 ～ 104 ；柱溫為常溫～300℃。
三、檢測器方面：
1、高效液相色譜儀
（1）選擇性檢測器：紫外可見檢測器、二極管陣列檢測器、熒光檢測器、電化學檢測器激光誘導熒光檢測器。
（2）通用型檢測器：蒸發激光散射檢測器、折光示差檢測器
2、氣相色譜儀
（1）選擇性檢測器：電子捕獲檢測器、氮磷檢測器、火焰光度檢測器
（2）通用型檢測器：熱導檢測器、火焰離子化檢測器
四、儀器的組成方面
1、高效液相色譜儀
溶質在液相中的擴散系數（10－5cm2/s）很小，因此在色譜柱以外的死空間應盡量小，以
減少柱外效應對分離效果的影響。
2、氣相色譜儀
溶質在氣相中的擴散系數（10－1cm2/s）大，在使用填充色譜柱時，柱外效應的影響較小，但是對于毛細管色譜柱也要盡量減少柱外效應對分離效果的影響。
五、操作條件方面
1、柱溫：高效液相色譜儀一般在室溫下操作，而氣相色譜儀須根據樣品設置色譜柱溫度。
2、高效液相色譜儀流動相的流速比氣相色譜儀流動相的流速慢1個數量級以上。
3、液體的粘度比氣體大100倍，密度大1000倍，所以高效液相色譜儀有很高的柱前壓力。
4、氣體可以壓縮，氣相色譜儀用壓縮后的氣體的受控的釋放作為流動相的動力；但是液體不能壓縮，所以高效液相色譜儀只能用高壓輸液泵作為流動相的動力。
5、高效液相色譜儀的樣品回收比較容易，且可規模制備；氣相色譜儀的樣品大部分會被破壞。
6、決定氣相色譜儀分離好壞的主要操作條件是固定相、流動相流速和柱溫； 決定高效液相色譜儀分離好壞的主要操作條件是固定相、流動相流速和流動 相的組成。
7、在對付復雜樣品方面，氣相色譜儀可采用柱溫程序升溫辦法進行組份的分離；高效液相色譜儀則采用梯度洗脫的辦法。
