高效液相色譜儀是利用混合物各組分在固定相和流動相中溶解、分配或者吸附等化學作用性能的差異，使各組分在作相對運動的兩相中反復多次的受到上述各作用力而達到相互分離。高效液相色譜儀在食品分析，環境分析，生命科學，醫學檢驗以及無機分析等多種領域中得到了廣泛使用。一般來看，原則上80%-85%的有機物能夠使用高效液相色譜儀進行分析。
　　一、高效液相色譜儀在食品分析中的應用：
　　1、食品營養成分的分析：氨基酸，蛋白質，色素，礦物質，維生素，有機酸（鄰苯二甲酸、檸檬酸等）等分析。
　　2、食品添加劑的分析：抗氧化劑，防腐劑，甜味劑以及著色劑（像莧菜紅、檸檬黃、靛藍、亮藍，胭脂紅與日落黃等）等分析。
　　3、食品污染物的分析：霉菌毒素（如：黃桿菌毒素，黃曲霉毒素或者大腸桿菌毒素等），微量元素以及多環芳烴等分析。

　　二、高效液相色譜儀在環境分析中的應用：
　　多環芳烴（尤其是稠環芳烴）以及農藥殘留物質（氨基甲酸脂類或反相色譜）等的分析。

　　三、高效液相色譜儀在生命科學中的應用：
　　1、低分子量的物質：有機酸、氨基酸、有機胺、卟啉、類固醇、糖類以及維生素等分析。
　　2、高分子量的物質：多肽、核糖核酸、各種酶以及蛋白質等分析。

　　四、高效液相色譜儀在醫學檢驗中的應用：
　　1、合成藥物中：抗生素，抗憂郁藥物以及黃胺類藥等的分析。
　　2、天然藥物生物堿：吲哚堿，顛茄堿和強心甙等分析。

　　五、高效液相色譜儀在無機分析中的應用
　　1、對陽、陰離子等的分析。