在文獻中，離子色譜和高效液相色譜之間的界限有時是模糊的。其實這兩種方法是息息相關的。下面總結了高效液相色譜和離子色譜的區別。


　　分離機制

　　在高效液相色譜中，分離是基于分析物和固定相之間的疏水相互作用(反相高效液相色譜)或親水相互作用(正相高效液相色譜)。


　　這意味著該方法適用于極性和非極性有機化合物的分離。反相高效液相色譜是最廣泛使用的高效液相色譜模式類型。分離依賴于有機溶劑作為洗脫劑。在集成電路中，最關鍵的分離機制是離子交換。


　　根據應用，可以使用其他機制，例如離子配對和離子排斥。離子交換分離依賴于固定相中離子分析物和離子交換基團之間的化學反應，而不是高效液相色譜中的物理相互作用。


　　然而，當使用正確的流動相和色譜柱時，也可以使用集成電路設備分離非離子和極性化合物。這使得集成電路適用于分離有機和無機離子以及極性物質。


　　洗脫液


　　高效液相色譜分離是用有機溶劑作為洗脫劑進行的，通常采用梯度洗脫來獲得弱保留分析物的良好分辨率，使強保留分析物的洗脫速度更快。樣品通常也溶解在有機溶劑中，與洗脫液混溶。


　　與高效液相色譜不同，離子色譜中的分離發生在水相中。洗脫液通常由含有溶解鹽或酸的超純水組成。大多數離子色譜分離可以使用等度洗脫進行，即不需要梯度。


　　分離柱


　　高效液相色譜和離子色譜中的分離柱是基于表面修飾的顆粒作為固定相，它們與分析物相互作用進行分離。但表面功能化不同：HPLC中的固定相依賴于疏水(反相HPLC)或極性(正相HPLC)官能團，而ic則以陰離子或陽離子交換基團為特征。


　　集成電路柱不僅在內部與高效液相色譜柱不同：集成電路柱的外殼由化學惰性的聚醚醚酮制成，而不是不銹鋼，不銹鋼在暴露于集成電路中使用的洗脫液時容易腐蝕。


　　圖1。IC柱和HPLC柱的區別不僅僅在內部：IC柱的外殼是由化學惰性的PEEK代替不銹鋼制成的，當暴露在IC中使用的洗脫液中時容易被腐蝕。


　　檢測

　　紫外檢測器是高效液相色譜的主要檢測器。紫外檢測器可以檢測吸光物質，因為離開分離柱的洗脫液會受到紫外光的照射。根據不含樣品的流動相和含分析物的洗脫液之間的吸光度差異計算分析物。電導檢測器通常用于集成電路。通過測量洗脫液電導率的變化，可以檢測并定量分析物。電導率檢測是一種靈敏但非選擇性的檢測方法。