HPLC具有廣泛的用途。它可以分離、識別和量化可溶解在任何樣品中的化合物。如今，可以輕松識別低至萬億分之幾[ppt]的痕量化合物。HPLC可以并且已經應用??于幾乎所有樣品，例如藥品、食品、營養品、化妝品、環境基質、法醫樣品和工業化學品。它可用于分離、識別和量化各種成分、添加劑和污染物。
        
      
　　農藥

　　農藥是指“用于防止、破壞、驅除或減少任何有害生物的化學品，從昆蟲(即殺蟲劑)、嚙齒動物(即滅鼠劑)和雜草(除草劑)到微生物(即殺藻劑、殺真菌劑或殺真菌劑)”。顯然，它們有它們的優勢，即趕走害蟲，以最大限度地提高作物產量。

　　當農藥殘留殘留在食物上時，就會被人類攝入。在以前的研究中，農藥消費與各種類型的癌癥和生殖問題有關，如出生缺陷和不育。盡管如此，據估計超過90%的人含有殺蟲劑。

　　高效液相色譜法可用于檢測和定量目標分析物，以監控食品中的農藥含量，使其符合政府限制并保護消費者。


　　抗生素

　　食物中另一種潛在的有害成分是抗生素。這些給動物用來治療、預防和控制常見疾病。然而，像殺蟲劑一樣，它們可以作為殘留物留在食物鏈中。這里的主要風險是耐藥細菌可能會感染人類。

　　由于抗生素耐藥性每年導致上百萬人死亡，因此許多國家禁止抗生素也就不足為奇了，需要進行檢測以確保它們不會進入食物鏈。這是高效液相色譜可以幫助的另一個領域。


　　黃曲霉毒素

　　黃曲霉毒素是許多糧食作物中的自然問題，據估計，每年有25%的作物被黃曲霉毒素破壞。有毒物質是霉菌產生的，在高溫高濕下更容易滋生。由于儲存不當，黃曲霉毒素污染可能發生在堅果和谷物收獲前以及咖啡、香料和大米收獲后。

　　黃曲霉毒素至少有14種變種，但已知B1、B2、G1和G2對人類和動物最危險。利用高效液相色譜分析，可以識別和定量不同作物中的黃曲霉毒素污染。

　　另一種天然存在的污染物是丙烯酰胺，它是在高溫加工淀粉類食品時形成的。用于測定食品樣品中丙烯酰胺含量的選擇性和穩健的UHPLC-質譜/質譜來分析這種化學物質。


　　其他成分

　　除了殘留物和污染物，還有一系列其他成分可以添加到食品中，以增強其風味、外觀或使用壽命。由于使用了這些防腐劑、調味劑和著色劑，其中許多與健康問題有關，最終被禁用。因此，它們是要添加到高效液相色譜列表中的另一個領域。