一般液相色譜儀的系統主要是由儲液器，泵，進樣器，色譜柱以及檢測器和記錄儀等幾部分組成的。對于這幾部分的維護也是非常的重要。
　　一、泵
　　泵是液相色譜儀的心臟。在工作狀態比較穩定時的泵，基線平穩，保留的時間重現性較好，在梯度洗脫的時候壓力變化也會緩慢且平穩。
　　1、首先選擇合適的溶劑與試劑，其次在進入儀器之前先用0.45um的膜過濾，并且要進行脫氣處理。
　　2、泵在開始使用的時候，一定要用合適的流動相徹底地清洗干凈。
　　3、需要定期的檢查并且更換在線過濾片以及相關的墊圈，進液處的微孔濾頭也要經常的清洗。
　　4、改變流動相的時候，要注意下沉淀的產生，防止其造成泵的堵塞。
　　二、色譜柱
　　色譜柱它是化合物分離的關鍵。一些保養較好的色譜柱具有很高的塔板數并且基線平穩。
　　1、色譜柱比較脆弱，不可以碰撞，彎曲或者是強烈的震蕩；安裝的時候需要保證其閥件以及管路的清潔。
　　2、在使用流動相之前，必須要先進行脫氣處理，盡量可以不使用或者是少使用高粘度的流動相。
　　3、在滿足靈敏度的前提下，盡可能的使用小進樣量。如果樣品不干凈，需要先進行凈化或者是提純處理。
　　4、分析結束后，要清洗掉進樣閥中的一些殘留樣品，并用流動相或者適當的溶劑清洗色譜柱。
　　5、如果是長期的不使用，要用合適的有機溶劑保存并且封閉或者是定期的補充合適的流動相。
　　三、檢測器
　　在分析完成之后，立即關閉其檢測器。
　   四、進樣器

　　分析結束之后，反復的沖洗下進樣口，防止樣品的交叉感染或者堵塞。