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高效液相是精密分析儀器，隨著技術的改進，其對實驗水質要求也越來越高，當今的高效液相，一般都要求用戶使用超純水定出平坦而沒有波峰的基線以保證分析測試的靈敏度，但也有少部分企業，由于某些原因，使用純凈水或蒸餾水來進行試驗，但是常達不到想要的效果。
專家表示，一般的純凈水、蒸餾水中，都含有少量離子和有機物等雜質，用以配制液相和洗脫液不僅可能污堵昂貴的色譜柱，也影響HPLC定出平坦的基線。工程師表示，瓶裝純凈水的純化工藝，通常包括吸附、過濾、反滲透等，對顆粒性有機物的去除效果較好，但對微量有機物的去除，卻不能滿足高靈敏度的高效液相的實驗需求，并且，由于其包裝通常多為PVC瓶，透氧率高，同時存在一定的化學溶出量，從而污染瓶中的純凈水，尤其是保存一段時間后，水質下降更多，因此表現在HPLC色譜圖上，雖無特定吸收峰，但基線存在較嚴重的不穩干擾。
另外，有專家對重蒸水進行HPLC檢測時發現，254nm和214nm在22-27分鐘時都出現較強的吸收峰，這表明有疏水性較強的有機物污染，其原因應是蒸餾過程的共沸現象導致了某些揮發性有機物去除不徹底。
