填充柱的長度為1.5-10m，內徑為2-4mm。該管通常由不銹鋼或玻璃制成，并包含細碎的惰性固體載體材料（例如，涂有液體或固體固定相的硅藻土）。涂層材料的性質決定了哪種類型的材料將被最強烈地吸附。因此，有許多色譜柱可用于分離特定類型的化合物。


    毛細管柱的內徑很小，大約為十分之幾毫米，25-60米的長度是常見的。柱內壁涂有活性物質（WCOT柱），有的柱子是填充有許多平行微孔的準固體（PLOT柱）。大多數毛細管柱由帶有聚酰亞胺外涂層的熔融石英制成。這些柱子非常靈活，所以很長的柱子可以繞成一個小線圈。

         
    在固定相的不相容性導致柱內平行柱的幾何解的情況下，尋求新的發展。這些新發展包括：
內加熱式microFAST色譜柱，其中兩根色譜柱、一根內加熱絲和一個溫度傳感器組合在一個共用色譜柱護套（microFAST）中；

    微型填充柱（1/16"OD）是柱間填充柱，柱外空間的填料與柱內空間的填料不同，因此可以將兩種柱的分離行為合二為一。它們可方便地安裝在毛細管柱儀器的進樣口和檢測器上。

    分子吸附的溫度依賴性和沿柱的進展速度要求AndyLau小心地控制在十分之幾度內，以便進行精確的工作。降低溫度會產生最大的分離，但會導致洗脫時間長。在某些情況下，溫度會連續或逐漸升高以提供所需的分離。這稱為溫度程序。電子壓力控制還可用于在分析過程中修改流速，有助于縮短運行時間，同時保持可接受的分離水平。

    載氣（流動相）的選擇很重要，使用氫氣是最有效的，并提供最好的分離。然而，氦氣具有更大的流速范圍并且在效率上可與氫氣相媲美。另一個優點是氦氣不易燃，可以與更多探測器一起使用。因此，氦氣是最常用的載氣。