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柱溫箱是用在液相色譜儀分析中控制色譜柱的溫度保持恒定的一種溫控儀器，它可以精確而穩定的控制色譜分析柱的穩定性，有利于提高色譜管柱的靈敏度，改善譜峰的分離度，加快分離速率，縮短分析時間，確保分析結果的準確性和再現性。對于液相色譜來說，柱溫升高可加快分離過程，但因樣品保留時間不穩將增加檢測工作的麻煩，分辨率也可能下降；相反，當柱溫低時，分辨率提高，但分離過程時間會加長，因為在溫度低的情況下，流動相黏度增加會延長檢測時間，增加泵的磨損，同時，溶解度相對下降會出現緩沖鹽結晶而堵塞泵、 進樣閥、管道、色譜柱的現象，雜質吸附在填料上而難于洗脫，從而影響色譜柱的使用壽命。
一般而言，色譜分析過程是靠流動相中的樣品和固定相的結合-分離差異達到分離物質的作用，溫度可以影響結合-分離過程，從而影響色譜分析過程。改變柱溫對分離度和峰形是有影響的,但影響比較小，影響色譜柱分離度的因素是固定相的種類、性質（粒度、粒徑分布等）、填充狀況、柱長、流動相的種類和流速及測定柱效所用物質的性質等。具體如下：
（1）色譜長度和填料的性質，色譜柱越長，組分之間分辯效果越好，但色譜柱越長壓降越大，而輸入的壓力是有限的。色譜柱過長會增大進出口壓力比，相反會降低分離度；
（2）色譜柱填料顆粒大小也是主要因素，粒子越細，由于表面積增加，分辯效果越好，但是顆粒細會增大柱壓降，也會起反作用；
（3）柱溫對分辯效果也有很大影響，因為氣體在液體中的溶解度或在固體表面的吸附程度都隨溫度增高而降低，在氣液色譜分析中，當超過一定溫度時，靜態的液體通常會從色譜柱中揮發掉，所以選擇柱溫時應考慮到樣品的沸點。一般是略低于樣品沸點的平均值；
（4）載氣種類的影響。常用的載氣有 N2、H2、He、Ar等，其中H2、He 氣的分子量較小，有利于提高分析速度，但濃度較高的介質易在其間形成擴散，影響分離度，所以在實際測量中H2、 He氣體一般都用在介質濃度較低的區域并提高其流速，減少擴散的影響。N2、Ar等分子量較大的氣體的優點是擴散作用小，缺點是在柱中壓降大流速慢，即分析周期長；
（5）載氣流速的影響。介質在固定相上的滯留時間，主要取決于介質自身的特性(揮發性，極性等)和載氣的流速。所以流速快慢直接影響分離度；
（6）進樣時間和進樣量的影響。進樣時間應盡量短，原則上的瞬間進樣會提高分離度。進樣量應盡量小，但應使檢測器能夠識別。
因此，提高色譜柱分離度可以通過增加柱長，減少進樣量，降低載氣流速，降低色譜柱溫度，提高汽化室溫度，減少系統的死體來實現。
