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重磅新品實現需求全覆蓋，安捷倫走在二代測序樣本質控最前沿
原創： 安捷倫 DGG 團隊 安捷倫視界
在上海慕尼黑生化展期間，一個即將面試的新核酸質控平臺 Agilent 4150 TapeStation 的首次亮相引起了廣泛關注。這不僅僅只是一臺新儀器的面世，更標志著安捷倫緊跟基因檢測行業“去集中化”的全球發展趨勢，實現了對不同類型客戶需求的全覆蓋。
慕尼黑上海分析生化展關鍵詞之——“去集中化”
隨著二代測序技術的普及，全球都呈現出了“去集中化”的趨勢，越來越多的中小規模實驗室也開始開展二代測序工作。這些中小規模的實驗室同樣有自動化和標準化的需求，因此他們需要一款既能夠滿足他們中低通量，又能夠實現自動化、標準化操作的平臺。為此，安捷倫在 Agilent 4200 TapeStation 系統的基礎上開發了 Agilent 4150 TapeStation 系統。
安捷倫診斷與基因組學事業部合影
4150 系統繼承 4200 的技術優勢，一次可以自動化分析 1 到 16 個任意數量的樣本，每個樣本分析時間在 1 到 2 分鐘；它使用與 4200 系統相同的預制膠條，保障了每個樣本的檢測成本恒定。與此同時，當未來用戶樣本量增加，可以無縫的遷移到 4200 系統上，兩者由于使用相同的試劑盒，數據間具有很好的可比性。
安捷倫生物分子分析事業部在上海慕尼黑展會上對產品進行展示
除了應對“去集中化”趨勢的新儀器，更有新應用
安捷倫在這一次慕尼黑的亮相，除了帶來了這款中低通亮的儀器之外，是否有新的應用推出？答案是肯定的，本次同 4150 系統一同前來的還有游離核酸（ cfDNA ）的應用。游離核酸無論是在生殖健康還是在腫瘤的早期發現與診斷上都是一個熱點的應用，然而游離核酸濃度低，且由于處理方法或提取方法的差異，游離核酸樣本中可能含有較大的核酸片段比如說基因組 DNA 的污染，這些高分子量的物質會對后續二代測序的文庫構建產生負面的影響，從而導致測試深度低。因此，我們需要一種檢測方式，它既有極高的靈敏度，又能夠對整個樣本質量進行全面的評估。安捷倫本次在慕尼黑上推出的游離核酸應用就是為了滿足這個領域的需求而開發的。
安捷倫這款游離核酸應用可以檢測低至 50 皮克/微升的游離核酸，并一步完成對游離核酸的定量和片段分析，同時它還可以檢測樣本中高分子量 DNA 的污染。4150 系統自帶的分析軟件可以自動化的計算游離核酸的純度，即游離核酸的百分比。每次檢測僅需 2 微升的樣本。安捷倫這一款游離核酸的分析不僅可以應用于二代測序，同時也適用于數字 PCR、定量 PCR，以及微陣列芯片的樣本質控和 4200 系統。
“小身材”的全能型選手
在本次慕尼黑會議高通量測序論壇上，安捷倫生物分子分析事業部全球產品經理 Rainer Nitsche 就安捷倫核酸質控平臺產品線進行了完整的介紹。分別展示了安捷倫 4150 和 4200 系統在基因組 DNA 、FFPE 樣本、RNA 樣本、以及游離核酸樣本上的應用案例，充分展現安捷倫平臺的全能性質優勢。這里我們就來分享幾個關于游離核酸質控的案例。
安捷倫生物分子分析事業部全球產品經理 Rainer Nitsche 正在向慕尼黑上海分析生化展的參會者介紹核酸質控平臺產品線
圖 1. 游離核酸分析的典型結果
如圖 1. 所示，主峰代表了約 170 bp 的單核小體；其他的 DNA 片段代表了核小體的多聚物；而大于 800 bp 的片段則代表了高分子量的 DNA。
圖 2. 顯示了不同純度的游離核酸的檢測結果
圖 2.中的三個顏色分別代表各不同純度的游離核酸，從電泳圖中（右）可以看出，紅色純度最低。從峰圖中（左）可以看出，紅色的樣本含有大量的分子量大于 800 bp 的高分子量 DNA 污染，這些高分子量的 DNA 片段會影響二代測序文庫的制備（他們會與接頭相結合，從而導致文庫產量下降）。
圖 3. Agilent TapeStation 軟件可自動分析游離核酸純度
安捷倫的游離核酸檢測方案，還可以自動分析游離核酸的純度。在本實驗中，我們預先將分析范圍設定為 50 至 800 bp 的范圍。游離核酸的百分比根據預設的范圍自動計算。游離核酸的百分比可以用于評估樣本的質量。圖 3. 中顯示的為高純度的游離核酸，其游離核酸百分比占 96%。
安捷倫全球產品經理 Rainer Nitsche 在上海慕尼黑分析生化展現場接受媒體專訪時還談到：
安捷倫生物分子分析事業部全球產品經理 Rainer Nitsche 接受媒體采訪
“ 安捷倫的核酸質控產品現不僅適用于針對二代測序質量控制的應用，同時在生物樣本庫等應用領域也發揮了重要的質控作用。安捷倫未來將不斷在硬件開發、應用開發上加大力度，推出更多更新的產品與應用。”
